癌症单细胞测序解读图

癌症晚期 2025-10-05 08:36癌症晚期www.aizhengw.cn

单细胞测序技术已成为研究癌症异质性和肿瘤微环境的重要工具，通过高分辨率单个细胞的转录组特征，为癌症研究提供了前所未有的精细视角。以下是关于癌症单细胞测序解读图的全面：

单细胞测序基础分析图谱

单细胞测序数据分析通常从以下几个基础图谱开始：

1. 降维聚类图(t-SNE/UAMP)：展示细胞群体在降维空间中的分布，不同颜色代表不同细胞亚群。这些图能直观显示肿瘤样本中各种细胞类型的组成和异质性

2. 细胞簇基因表达热图：横轴为不同细胞群，纵轴为差异表达基因，通过颜色梯度(如黄色代表高表达，紫色代表低表达)展示各细胞群的基因表达特征

3. 点图(Dot plot)：横轴为基因名称，纵轴为细胞簇，点的大小代表该簇中表达该基因的细胞比例，颜色代表表达水平高低

在癌症研究中，单细胞测序还产生了一些特殊类型的解读图：

1. 恶性细胞鉴定图：通过计算"恶性评分"与"非恶性评分"的差异，将上皮细胞分类为恶性和非恶性群体，常以散点图或t-SNE图展示

2. 细胞类型比例变化图：展示不同癌症阶段(如AAH、AIS、MIA、IA)或不同样本类型(肿瘤vs正常)中各细胞类型的比例变化，揭示肿瘤进展中的微环境重塑

3. 免疫细胞功能状态图：通过特定功能基因集的表达分析，展示不同免疫细胞亚群(如T细胞、B细胞、NK细胞)的功能状态变化

1. 发育轨迹图：展示肿瘤细胞或免疫细胞的发育分化轨迹，如单核细胞向M2巨噬细胞的分化过程

2. 细胞互作图：通过配体-受体分析展示肿瘤微环境中不同细胞类型间的相互作用网络

3. 空间异质性图：结合空间转录组数据，展示肿瘤不同区域(如中心vs边缘)的细胞组成和基因表达差异

1. 预后标志物图：通过生存分析关联特定细胞亚群或基因特征与患者预后，如食管癌中的3个关键生存标志物

2. 治疗反应图：展示治疗前后肿瘤微环境的变化，如新辅助治疗后非小细胞肺癌免疫微环境的改变

3. 亚型特异性图：比较不同分子亚型(如Luminal、HER2+、TNBC)乳腺癌的细胞组成和功能状态差异